Расположено село Джуен на западном берегу озера Болонь, в 10 км от железнодорожной станции Болонь.
История села началась в 1928 году, когда на берег озера Болонь переехали с реки Харпи семьи Андрея Бельды и Захара Киле и постороили здесь свои жилища. Вслед за ними стали перебираться сюда и другие рыбаки и охотники семьями.
Единого мнения о происхожении названия села нет. Одни переводят его от нанайского "Дюен" - в глубине находящийся мыс. Другие говорят, что от слова "Дюи" - ключ, родник. В окрестностях села находится несколько родников, и местные жители оберегают их.
В 1931 году в селе Джуен образовался колхоз, а через год была построена школа, где в 2-3 смены учились дети и взрослые. С 1934 по 1954 годы Джуен входил в состав Нанайского района, потом вернулся обратно в Комсомольский район. В состав Амурского района село Джуен входит с 1965 года.
Изначально и до сих пор местные жители занимались рыболовством и охотой. В советские годы в Джуене базировался рыболоветский колхоз. Он сменил несколько названий, последнее - колхоз имени Постышева. Сейчас традиционными промыслами КМНС занимаются родовые общины. В селе есть современная, построенная из камня школа и старый деревянный Дом культуры.
Неподалеку от с. Джуен на озере Болонь находится остров вулканического происхождения Ядасен, образовавшийся, как считается, на месте редчайшего в мире вулкана посреди пресноводного озера. Некоторые ученые считают, что через тысячу лет этот вулкан может проснуться.
